机构改革职务自然免除的怎么办

一般会妥善安排。

机构改革职务自然免除的，组织人事部门一般会根据机构改革的实际情况，重新统筹安排相应的职务。在这方面，改革方案出台时会有具体的规定。比如提前退休，改任非领导职务，调任相关单位任职等。当然作为个人也可以合理合法的表达自己的诉求。