木瓜最好的保存方法是放入阴凉干燥的地方保存，阴凉的环境下可以减缓细菌等微生物的生长繁殖，适当的延长木瓜的保质期。
干燥的环境下可以防止木瓜因为吸水而产生黑斑，产生一些细菌、霉菌等微生物，防止其变质，也可以延长保质期。
