应该说一条船和一只船是同样的，是正确的。不过一只船通指小船，如舟艇等。一条船通用即可指小船也可指大船，如一条万吨巨轮。
答案是：一条船、一只船都正确。表示船的数量单位有“条、只、艘”，根据船的大小来决定该使用哪个量词。
如对于小的船一般用“只”和“条”，所以船只搭配在一起的时候往往表示船比较小对于较大的船就得使用“艘”，如一艘军舰、一艘航空母舰等。
