缺点: 水马桶冲水时先要放水至很高的水面，然后才将污物冲下去，所以要具备一定水量才可达到冲净的目的，每次至少要用8升至9升水，相对来说比较费水。
后排水马桶的排水管径也就56公分左右，冲水时容易堵塞，所以手纸不能直接扔在马桶里中，安装虹吸式座便器一般还要配备纸篓和搋子。
修理很不方便，有时候必须得把墙凿开。承受的重力相对于地排马桶较小。内部零件损坏较快。
