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斑点叉尾鮰育苗常用的水源有地下水和地表水。一般来讲，地下水是斑点叉尾鮰繁殖孵化的最好水源，因为地下水通常没有悬浮物、未受污染，也不存在病原菌，水温和水化学成分相对较稳定。地表水包括溪流、江河、池塘、湖泊和水库，无污染的地表水作为水源要优于地下。
